Мехрибан Алиева (урождённая Пашаева) родилась 26 августа 1964 года в Баку, в семье учёных. Её отец, Ариф Пашаев, сын писателя и литературного критика Мир Джалала Пашаева, является ректором бакинской Национальной Академии Авиации, а мать — Аида Иманкулиева (ум. 1992), дочь выдающегося азербайджанского журналиста Насира Иманкулиева, была известным филологом и арабистом.
В 1982 году Мехрибан Алиева окончила с золотой медалью бакинскую среднюю школу № 23. Несколько месяцев спустя она поступила в Азербайджанский Медицинский Университет и продолжила обучение в Московской Медицинской Академии имени И. М. Сеченова, которую она окончила с красным дипломом в 1988 году.
Мехрибан Пашаева вышла замуж за Ильхама Алиева 22 декабря 1983 года в Баку. У них две дочери, Лейла (1986 г.) и Арзу (1989 г), и сын Гейдар (1997 г). В 2006 году Лейла Алиева вышла замуж за предпринимателя и музыканта Эмина Агаларова. Бабушка двух мальчиков-близнецов, которых родила Лейла Алиева 1.12.2008 года.